Yeni California Varyantı Orada Virüs Dalgalanmasına Neden Olabilir, Çalışma Önerileri

Aralık ayının sonlarında, Kaliforniya’daki bilim adamları, İngiltere’de henüz tanımlanmış olan hızlı yayılan yeni bir varyant için koronavirüs numunelerini aramaya başladı.

Nispeten az sayıda örnekte olsa da buldular. Ancak bu süreçte, bilim adamları başka bir istenmeyen keşif daha yaptılar: Kaliforniya kendi türünün bir varyantını üretmişti.

CAL olarak bilinen bir soya ait olan bu mutant. 20C, Temmuz ayında ortaya çıktı, ancak Kasım ayına kadar düşük kaldı. Sonra hızla yayılmaya başladı.

CAL. Henüz yayınlanmayan yeni bir çalışmaya göre, 20C, 13 Ocak’ta Los Angeles laboratuvarlarında toplanan virüs genom örneklerinin yarısından fazlasını oluşturdu.

Los Angeles’taki Cedars-Sinai Tıp Merkezi’nde yeni çalışma üzerinde çalışan araştırmacı bilim insanı Jasmine Plummer, “Avrupa’dan geçmeyen kendi sorunumuz vardı,” dedi. “Gerçekten burada ortaya çıktı ve tatil boyunca ortaya çıkma ve dalgalanma şansı buldu. ”

CAL’a dair bir kanıt yok. 20C, diğer varyantlardan daha öldürücüdür. Ve bilim adamlarının CAL olup olmadığını belirlemek için daha fazla araştırma yapması gerekiyor. 20C aslında virüsün diğer formlarından daha bulaşıcıdır.

Ancak Cedars-Sinai’deki moleküler patoloji direktörü Eric Vail, CAL’nin mümkün olduğunu söyledi. 20C, Güney Kaliforniya hastanelerini alt üst eden vakaların artmasında büyük rol oynuyor. Dr. Vail, “Bunun virüsün daha bulaşıcı bir türü olduğundan oldukça eminim,” dedi.

San Francisco’daki California Üniversitesi’nde virolog olan Dr. Charles Chiu, eyalet genelinde kendisinin ve meslektaşlarının varyantı dizilenen örneklerin yaklaşık yüzde 20 ila 30’unda bulduklarını söyledi. “Burnumuzun dibinde belirdi ve şimdi birçok ilçede yükseliyor,” dedi. “Genel olarak, California’nın dışına yayılacağını söylemek güvenli. ”

Araştırmacılar ayrıca CAL için başka eyaletlerde de arıyorlar. Plummer, 20C, dedi ve şimdiye kadar Arizona, Connecticut, Maryland, New Mexico, Nevada, New York, Texas, Utah, Washington ve Wyoming ile Columbia Bölgesi’nde buldu. Kaliforniya dışında ne kadar yaygın olduğu henüz belli değil.

Geçen hafta Hastalık Kontrol ve Önleme Merkezleri, Britanya’nın bataklığı hakkında resmi bir uyarı yayınladı. B. 1. 1. 7 adı verilen bu mutant, Amerika Birleşik Devletleri’nde hala nispeten nadir görülmesine ve enfeksiyonların yüzde yarısından azına tekabül etmesine rağmen, ajans Mart ayına kadar ülkenin vakalarının çoğundan sorumlu olabileceğini söyledi.

Bir ajans sözcüsü, C.D.C.’nin yeni varyant hakkında daha fazla bilgi edinmek için California ile çalıştığını söyledi. “Şu anda, bu varyantın diğer SARS-CoV-2 virüslerinden farklı olup olmadığı, bu farklılıkların ortaya çıkmasına katkıda bulunmuş olabileceği veya bu ortaya çıkmanın sadece rastgele bir olay olup olmadığı bilinmemektedir” dedi.

Amerika Birleşik Devletleri’nde B. 1. 1. 7’nin ilk örneklerinden birini keşfeden Scripps Araştırma Enstitüsü’nden virolog Kristian Andersen, “Bu özel varyantın izlenebileceğini söyleyeceğim,” dedi. Ancak CAL olup olmadığının hala belirsiz olduğu konusunda uyardı. C20 daha yaygın hale geliyor çünkü biyolojik bir avantajı var ya da sadece şans eseri.

Hem B. 1. 1. 7 hem de CAL. C20’nin ikisi de diğer varyantlardan daha bulaşıcıdır, ikisi arasındaki rekabetin nasıl sonuçlanacağı net değildir. “CAL. C20 büyük bir avantaja sahip, ”dedi Dr. Vail. “B. 1. 1. 7 genel olarak daha bulaşıcı olsa bile, burada L. A.’da bundan büyük bir artış asla göremeyebiliriz.”

Los Angeles’taki Lincoln Park’ta Covid-19 testi. Kredi. . . The New York Times için Philip Cheung

Bilim adamları yeni koronavirüsü bir yıl önce Çin’de ilk kez tespit ettiklerinden beri, rastgele ortaya çıkan ve vücudumuzda çoğalırken yeni nesil virüslere aktarılan yeni mutasyonların ortaya çıkışını izliyorlar.

Pek çok mutasyon virüse zararlıdır ve kopyalanmayı daha da kötüleştirir. Diğerleri tarafsızdır. Ancak araştırmacılar, virüsün insanları daha verimli bir şekilde enfekte etmesine yardımcı oldukları için endişe verici birkaç şey keşfettiler.

Pandeminin ilk aylarında, bir soyda bir mutasyon ortaya çıktı ve daha sonra dünyanın büyük bir bölümünde egemen oldu. D614G olarak bilinen mutasyonun, virüsün, virüsü olmayan varyantlara kıyasla, insandan insana daha kolay bulaşmasını sağladığına inanılıyor.

Aralık ayında, İngiltere’deki araştırmacılar, virüsün önceki sürümlerinden yaklaşık yüzde 50 daha fazla bulaşıcı olan B. 1. 1. 7’yi buldular. Değişken, şu anda oradaki vakaların ve hastaneye yatışların artmasında itici bir faktördür.

B. 1. 1. 7 Kasım ayı başlarında, Arizona Üniversitesi biyologları Brendan Larsen ve Michael Worobey tarafından Salı günü çevrimiçi olarak yayınlanan bir araştırmaya göre, Amerika Birleşik Devletleri’ndeydi. Bu, varyantın tespit edilmeden önce iki aydır dolaşımda olduğu anlamına gelir.

California’da, B. 1. 1. 7’yi arayan araştırmacılar, örneklerinde olağandışı bir mutasyon fark etmeye başladı. L452R adı verilen mutasyon, koronavirüsün yüzeyini süsleyen başak adı verilen bir proteinin şeklini değiştirir.

Dr. Vail, “Bu gerçekten beklenmedik bulguya rastladık ve oradan devam ettik,” dedi.

Mutasyon, geçen yıl farklı viral soylarda ortaya çıktı. Bilim adamları, koronavirüslerin hücrelerimize yapışmasına ve onları enfekte etmesine yardımcı olabileceği için L452R üzerinde çalıştılar.

California’da, Dr. Vail, Dr. Plummer ve meslektaşları, L452 mutasyonu ile bir varyantla karşılaştıklarında, bunun ayrıca dört farklı mutasyon daha taşıdığını keşfettiler. Bu kombinasyon, Kaliforniya’da bir noktada ortaya çıkan tek bir soyla uğraştıklarını belirtti. Araştırmacılar, beş mutasyonun tümünü CAL taşıyan herhangi bir virüsü adlandırdı. C20.

California Sağlık Bakanlığı, L452 mutasyonunun California’da daha yaygın hale geldiğini duyurmak için Pazar gecesi bir basın toplantısı düzenledi. Pazartesi gecesi Cedars-Sinai, araştırmasıyla ilgili bir haber yayınladı ve bu haber kısa süre sonra ön baskı web sitesi MedRxiv’de yayınlanacak.

Cedars-Sinai ekibi, koronavirüsteki mutasyonları izleyen eyalet çapında bir araştırmacı ağının parçasıdır. Covid-19 testi pozitif çıkan hastalardan rastgele nazal swablar seçtiler ve ardından swablardan genetik materyal topladılar.

Araştırmacılar, virüsün tüm genomunu yeniden yapılandırmak için parçaları bir araya getirdi ve ardından farklı mutasyonları aradılar. Daha sonra kendi bulgularını eyalet ve ülke genelinde dizilenen diğer viral genomlarla karşılaştırdılar.

Araştırmacılar en eski CAL örneğini buldular. C20, Temmuz ayında Los Angeles’ta. Ekim ayına kadar başka bir örnek bulamadılar. Varyant Kasım ayında daha yaygın hale geldi ve Aralık ayında Cedars-Sinai’den alınan numunelerin yüzde 36’sına ve geçen hafta yüzde 50’sine ulaştı.

Dışarıdaki bilim adamları yeni bulgularla ilgileniyorlar, ancak California varyantının mutasyonlarının ona bir avantaj sağlayıp sağlamadığının ya da sadece şans eseri bu kadar çok ortaya çıkıp çıkmadığının hala belirsiz olduğunu söylüyorlar.

Örneğin, bilim adamlarının baktığı örneklerde bir önyargı olabilir. CAL da mümkündür. Bazı büyük süper yayıcı olaylar sayesinde C20 daha yaygın hale geldi.

Dr. Worobey, “Belirli bir soyun, insan davranışlarının neden olduğu bir dalgayı sürmek yerine bir aktarım avantajı nedeniyle yayıldığı sonucuna varmadan önce dikkatli olmamız gerektiğini düşünüyorum” dedi.

Daha bulaşıcı olduğu ortaya çıkarsa, Dr. Plummer, o zaman CAL dedi. C20, Güney Kaliforniya hastanelerindeki son zamanlardaki sakatlayıcı vakalardan kısmen sorumlu olabilir.

Toplam vaka sayısı arttıkça, Dr. Plummer ve meslektaşı CAL yüzdesini buldu. C20 de yükseldi. Bu, bunun daha bulaşıcı bir varyant olduğu fikriyle tutarlı olacaktır. Demek istediğim, sayılar kendileri için konuşuyor, dedi.

Dr. Chiu, varyantın çok sayıda insanın enfekte olduğu bir dizi salgına karıştığını da belirtti. “Bu varyantın son derece aktarılabilir olabileceğine dair endişe verici işaretler var” dedi.

Dr. Chiu ve meslektaşları, diğer varyantlara kıyasla ne kadar hızlı çoğaldıklarını görmek için şimdi hücrelerde varyantı büyütüyor. Araştırmacılar ayrıca aşılar tarafından üretilen antikorların CAL’ye karşı ne kadar iyi çalıştığını gözlemleyecekler. C20.

Diğer bilim adamları da varyantın Kaliforniya’daki sıklığındaki artışa daha yakından bakıyorlar. Biyolojinin mi yoksa şansın mı yükselişinden sorumlu olduğunu belirleyebilecek kanıt arıyorlar.

Dr. Vail, “Yapılması gereken iş bu,” dedi. “Sadece bu bilgiye sahip değiliz. “