LONDRA – Birdenbire, koronavirüs değişmiş gibi görünüyordu.
Bir bulaşıcı hastalık uzmanı olan Dr. Steven Kemp aylardır küresel bir koronavirüs genom kütüphanesini tarıyordu. Yakındaki bir Cambridge hastanesinde şiddetli bir enfeksiyonu sallamak için mücadele eden bir hastanın akciğerlerinde virüsün nasıl mutasyona uğradığını inceliyordu ve bu değişikliklerin başka insanlarda ortaya çıkıp çıkmayacağını bilmek istedi.
Sonra Kasım ayı sonlarında, Dr. Kemp şaşırtıcı bir eşleşme yaptı: Hastada tespit edilen aynı mutasyonlardan bazıları, diğer değişikliklerle birlikte, çoğu Britanya’da, yeni enfekte olmuş insanlarda tekrar tekrar ortaya çıkıyordu.
Daha da kötüsü, değişiklikler, virüsün insan hücrelerine tutunmak için kullandığı başak proteininde yoğunlaştı ve bu da, halihazırda dünya çapında hasara yol açan bir virüsün, onu daha da bulaşıcı hale getirebilecek şekilde evrimleştiğini gösteriyor.
2 Aralık’ta Cambridge virologlarından Dr. Ravindra Gupta’ya “Aynı frekansta birlikte meydana gelen bir sürü mutasyon var” diye yazdı. En rahatsız edici değişiklikleri listeleyerek şunları ekledi: “Bu dizilerin TÜMÜ aşağıdaki başak mutantlara sahip. “
İki araştırmacı henüz bilmiyordu, ancak o zamandan beri Britanya genelinde damgalanan, bilim adamlarının virüsü anlamasını sarsan ve salgının küresel iyileşmesini engellemekle tehdit eden yeni, oldukça bulaşıcı bir koronavirüs varyantı bulmuşlardı.
Sözler, Ebola ve Zika salgınlarının izlenmesine yardımcı olan, genom biliminde uzun süredir meşale taşıyan İngiliz hastalık bilimcilerinden oluşan bir konsorsiyum aracılığıyla yarıştı. Slack’te ve video görüşmelerinde bir araya geldiler, ipuçlarını takip ederken notları karşılaştırdılar, aralarında Güney Afrika’daki bilim adamlarının bir başka yeni varyantı hakkında bir ipucu. O zamandan beri Brezilya’da diğerleri ortaya çıktı.
Yaklaşık bir yıldır, bilim adamları koronavirüste yalnızca artan değişiklikleri gözlemlediler ve aynısını daha fazlasını bekliyorlardı. Yeni varyantlar onları düşüncelerini değiştirmeye zorlayarak, pandemide virüsün aşıların etkinliğini zayıflatacak kadar zaman içinde gelişebileceği yeni bir aşamaya işaret etti.
Bir bilim adamı, Cambridge’deki Jeffrey Cheah Biyomedikal Merkezi’ndeki araştırma laboratuvarlarında koronavirüs örneklerini alıyor. Kredi. . . The New York Times için Mary Turner
İngiliz milletvekilleri haberi 14 Aralık’ta duyurarak varyantın öncekilerden daha hızlı yayıldığını bildirdi.
Ancak, İngiltere’nin toplu halde koronavirüs örneklerini sıralamaya başlamasına karar verdiği Mart ayında, keşfine giden yol çok az beğeni topladı. Ülke, dünyadaki koronavirüs genom envanterinin yarısını üretiyor ve virüsün nasıl değiştiğine ve insanların onu geçen yıl İngiltere’ye nasıl getirdiklerine dair benzersiz bir görüş sağlıyor ve şimdi varyantı dışarı taşıyor.
Britanya için keşif, hastanelerini hayat kurtaran bakımı reddetmek zorunda kalmanın eşiğine getiren cezalandırıcı yeni Covid-19 dalgasını önlemek için çok geç geldi. Varyant, sonbaharda ve kışın başlarında hükümetin gevşek kısıtlamaları nedeniyle halihazırda hızla yayılıyordu.
Ancak İngiltere, ülkelere sınırlarını kapatmalarına ve aksi takdirde aylardır fark edemeyecekleri bir varyantı çılgınca aramalarına izin vererek dünya için bir alarm verdi. İngiliz bilim adamları, şüphecileri gücüne ikna eden çalışmaları hızla yayınladılar.
Bir epidemiyolog ve hükümet danışmanı olan Neil Ferguson, “Birleşik Devletler, bu salgınla ilgili pek çok şeyi yanlış anladı, esasen erken tepki vermenin önemi hakkında ders almadılar,” dedi. Ancak Birleşik Krallık, Covid için oldukça benzersiz bir gözetim sistemine sahip. Virüsteki çok küçük değişiklikleri izleyebiliriz. ”
İngiltere’deki laboratuarlar, virüs için sürüntüleri test ettikten sonra, arta kalan malzemeyi soğutulmuş kamyonetlerle bir genomik laboratuvarı olan Wellcome Sanger Enstitüsü’ne gönderiyor ve burada derin dondurucularda saklanıyor.
Orada, robotlar pozitif numuneleri ayırır ve bunları küçük, çörek-kalay benzeri tabakların kuyularına bırakır. Dizileme projesini yöneten ve bir internet kütüphanesine yüklenen 30.000 harf uzunluğunda genetik kod üreten Jeffrey Barrett, makinelerin daha sonra genomlarını haritalandırdığını söyledi. Mutasyonları anlamlandırma görevi, evrim ağacında nereye uyduklarını belirleyen Edinburgh’da bir profesör olan Andrew Rambaut gibi biyologlara düşüyor.
Bu çaba Britanya’da 165.000’den fazla sekans oluşturdu. Amerika Birleşik Devletleri, beş kat fazla insanla yaklaşık 74.000 genom diziledi. Almanya, yalnızca Perşembe günü İngiltere’nin küresel veritabanına yüklediğinin yarısından azı, yaklaşık 3.400’ü sıraladı.
University College London’dan virolog Judith Breuer, “Virüsle baş etme şeklimizde tamamen devrim yarattı” dedi.
Kampanya 4 Mart’ta, İngiltere’de 100 koronavirüs enfeksiyonu bulunmadan önce, bir Cambridge mikrobiyoloğu Sharon Peacock, İngiliz genomistlerine bir dizi e-posta gönderip her birine sordu: “Beni arayabilir misin lütfen? ”
İki hafta içinde, yeni oluşturdukları konsorsiyumlar 20 milyon İngiliz sterlini, yani yaklaşık 27 milyon dolar, hükümet fonundan aldı.
Galler’deki bir bilim insanı olan Thomas Connor, “Burada yakın bir topluluk var ve Mart ayında herhangi bir rekabeti, egoları etkin bir şekilde bir kenara bıraktı ve sadece ‘Salgını yönetmede kritik bir rol oynayabiliriz’ dedi. genomları harmanlamak ve analiz etmek için bir platform oluşturdu.
Geçen yaz dizilenen örnekler arasında, Mayıs ayında Covid-19 tedavisi için Cambridge hastanesine kabul edilen 70’li yaşlarında lenfomalı bir adamın örnekleri vardı. Yarı zamanlı bir klinisyen olan Dr. Gupta, antikanser ilaçları bağışıklık tepkisini azaltmış olan hastayı tedavi etmeye başladı. Bir tecrit odasında tutulan hasta nefes almakta zorlandı. İyileşen hastalardan alınan antikorlarla plazma dahil birkaç tedavi turundan sonra bile virüs kaybolmadı.
Bunun yerine, mutasyona uğradı. Britanya’nın sıralama çabaları bu değişikliklere bir pencere açtı: Hastanede 101 günden fazla bir süredir, adamın akciğerlerinde dolaşan viral parçacıklar, bir ipucu hazinesi olarak 23 kez dizildi.
Hasta Ağustos ayında, görünüşe göre başka kimseye bulaşmadan öldü. Ancak virüsündeki mutasyonlar sonunda bilim insanlarına İngiliz varyantının nasıl ortaya çıktığına dair öncü bir teori sağladı: Cambridge hastası gibi zayıflamış bir bağışıklık sistemine ve uzun süreli bir enfeksiyona sahip birinin bağışıklık savunmasını atlatarak.
Dr. Kemp, “Buna, bir konakçıdaki farklı viral popülasyonları değerlendirmek için altın standart hasta diyoruz” dedi.
Hastanın sahip olduğu 69-70del etiketli bir mutasyon, başak proteinin şeklini değiştirir. Bir diğeri, N501Y, proteinin insan hücrelerine daha sıkı bağlanmasına yardımcı olabilir.
Dr. Kemp, birkaç günde bir küresel veri tabanında bu değişiklikleri aradı ve endişelenmek için çok az neden buldu. Sonra Kasım ayının sonlarında, aniden, çoğu Britanya’dan, bu mutasyonlara ve virüsün insan hücrelerine girme şeklini değiştirebilecek bir dizi başka genomu fark etti. Doktor Gupta’yı bir göz atmak için bilgisayarına çağırdı.
Sonunda, İngiliz bilim adamları, bu genomları Çin’in Wuhan kentinde bilinen en eski versiyondan ayıran 23 mutasyon tespit ettiler – B.1 olarak etiketlendiğinden beri yeni bir varyant olarak kabul edilmeye yetecek kadar. 1. 7. Bir evrim ağacında Dr. Kemp yaptı, tek başına, cılız bir dal gibi ayrı durdu.
Dr. Gupta, “Böyle bir şey beklemiyordum” dedi. “Kasım ayının sonunda, her şey aşı ümidiyle ilgiliydi ve ortaya çıkan yeni çeşitlerin kokusu yoktu. ”
Başak proteinindeki mutasyonların sayısı onu özellikle salladı, dedi ve buna “Vay be” anı dedi. ”
Aynı zamanda, İngiltere’nin halk sağlığı uzmanları, açıklanamayan bir koronavirüs vakası salgını üzerine kafa yoruyorlardı. Bir kilitlenme, virüsü İngiltere genelinde hafifletmişti, ancak Londra’nın bir ilçesi olan ve güneydoğudaki meyve bahçeleri olan Kent’te değil. Okullarda vakalar ortaya çıkıyordu. 328 kişiden biri enfekte oldu.
Halk sağlığı yetkilileri, sadece 8 Aralık’ta, genomikçilerle düzenli toplantılarında, nedenin muhtemelen yeni bir varyant olduğu sonucuna vardılar. Bilim adamları, veritabanlarına baktıklarında, ilk olarak Eylül ayında toplandığını ve insanlar ofislere döndükçe ve hükümetin teşvikiyle restoran ve barları korurken yayıldığını keşfettiler.
Araştırmacılar sonunda varyantın aslında daha aktarılabilir olduğuna – kabaca yüzde 30 ila 50 daha fazla – ama ancak daha az kesin ipuçlarından oluşan bir yama parçası oluşturduktan sonra ikna oldular.
Oxford evrimsel biyolog Oliver Pybus, “Tamamen kesin bir kanıt yok – bilim bu türden bir kesinliği yalnızca daha uzun zaman dilimleri içinde üretir,” dedi. Bu daha çok farklı, bağımsız kanıtların bir araya geldiği bir durumdu. ”
Bilim adamları, 11 Aralık’ta kararlarını bir hükümet danışma organına sunduktan sonra, epidemiyolog Dr. Ferguson, bunun “neredeyse kesinlikle başka bir kilit altına girmemizi gerektireceği konusunda endişelendi. Başbakan Boris Johnson’ın baş bilimsel danışmanına mesaj atarak varyant hakkında uyarıda bulundu.
22 Aralık’ta hükümet bilim adamları, varyantı bastırmak için okulların kapatılması da dahil olmak üzere katı önlemlere ihtiyaç olduğunu söyledi. Ancak Bay Johnson, İngiltere’nin bazı bölgelerindeki insanların Noel’de toplanmasına izin verdi ve 4 Ocak’a kadar İngiltere çapında bir tecrit uygulamadı.
Varyantın şu anda Londra’daki pozitif vakaların yüzde 80’inden fazlasını ve İngiltere’nin başka yerlerindeki enfeksiyonların en az dörtte birini oluşturduğu tahmin ediliyor ve 50’den fazla ülkede ortaya çıktı. Amerikalı sağlık yetkilileri Cuma günü, İngiliz varyantının Mart ayına kadar Amerika Birleşik Devletleri’nde baskın enfeksiyon kaynağı olabileceği konusunda uyardı.
Son günlerde, Dr. Gupta ve Dr. Kemp, varyantın aşıların gücünü zayıflatıp zayıflatmayacağını belirlemek için aşılanmış kişilerin kan serumunu kullanmaya başladılar.
Dr. Gupta, “Dünyaya uzun zamandır mutasyonların koronavirüsten gerçekten önemli olmadığı söylendi” dedi. “Ancak mutasyonların geldiğini ve virüsün uygunluğunu etkilediğini gördük. “
Bir The New York Times haberinden çevrildi ve haberleştirildi.