Varyant Avcıları: Güney Afrika’nın Tehlikeli Mutasyonları Durdurma Çabasının İçinde

NTUZUMA, Güney Afrika — Birkaç ay önce, Durban şehrinin kenarındaki bu geniş yamaç kasabasında toplum sağlığı çalışanı olan Sizakele Mathe, bir klinik tarafından bir komşusunun ilacını almayı bıraktığını bildirdi. Bu, H. I. V. enfeksiyonunu baskılayan antiretroviral tableti almayı bıraktığına dair bir uyarı işaretiydi.

Bu onun kendi sağlığına yönelik bir tehditti ve Covid-19 döneminde diğer herkesin sağlığı için bir risk oluşturmuş olabilir. Klinik, Bayan Mathe’yi bir tepeye tırmanması, dar bir yoldan aşağı inmesi ve kadını hapları geri almaya çalışması için gönderdi.

Bayan Mathe, amansız olduğu kadar neşeli, ulusal bir kapı kapı dırdır kampanyasının bir parçasıdır. Burada tanımlanan ve geçen hafta dünyayı sarsan Omicron gibi koronavirüsün yeni varyantlarının ortaya çıkmasını engellemek için Güney Afrika’nın karmaşık bir çabasının yarısı.

Diğer yarısı, yolun 25 mil aşağısındaki son teknoloji bir laboratuvarda gerçekleşir. Durban’daki KwaZulu-Natal Araştırma İnovasyon ve Sıralama Platformunda, bilim adamları her hafta binlerce koronavirüs örneğinin genomunu sıralıyor. Bilindiği gibi KRISP laboratuvarı, hem Beta hem de Omicron varyantlarını tanımlayan ulusal bir virüs araştırmacıları ağının parçası ve bölgenin H. I. V.

Yüksek teknoloji ve tabandan oluşan bu kombinasyon, dünyanın gelişen koronavirüse karşı savaşında ön saflardan birini temsil ediyor. Cuma günü, Güney Afrika’daki araştırma ağı, yeni varyantın, virüsün en bulaşıcı versiyonu olarak kabul edilen Delta’dan iki kat daha hızlı yayıldığını ortaya koydu.

KRISP’deki araştırmacılar, virüsler arasındaki evrimsel ilişkinin incelenmesi olan viral filogenetikte küresel liderlerdir. Koronavirüsteki mutasyonları izliyorlar, sıcak bulaşma noktalarını belirliyorlar ve kimin kime bulaştığına dair önemli veriler sağlıyorlar – ki bunlar, virüsteki mutasyonları numuneler arasında izleyerek çıkarsayarak – yayılmayı engellemeye yardımcı oluyorlar.

Pandeminin başlangıcından bu yana, virüsün Güney Afrika’da nasıl değiştiğini yakından inceliyorlar çünkü özellikle bir şey için endişeleniyorlar: ülkede H. I. V ile yaşayan sekiz milyon insan (nüfusun yüzde 13’ü).

H.I.V.’li kişilere etkili bir antiretroviral reçete edildiğinde ve bunu tutarlı bir şekilde aldıklarında, vücutları virüsü neredeyse tamamen bastırır. Ancak H. I. V.’li kişiler teşhis edilmezse, tedavi reçete edilmezse veya ilaçlarını her gün düzenli olarak almazsa veya alamıyorsa, H. I. V. onların bağışıklık sistemlerini zayıflatır. Daha sonra koronavirüse yakalanırlarsa, yeni virüsün vücutlarından atılması haftalar veya aylar alabilir.

Koronavirüs sistemlerinde bu kadar uzun süre yaşadığında, mutasyona uğrama ve mutasyona uğrama ve tekrar mutasyona uğrama şansı vardır. Ve mutasyona uğramış virüsü geçirirlerse, yeni bir varyant dolaşımda olur.

Ulusal genetik izleme ağının baş araştırmacısı Tulio de Oliveira, “Güney Afrika’da ortaya çıkan bazı varyantların potansiyel olarak doğrudan H. I. V. ile ilişkili olabileceğine inanmak için nedenlerimiz var” dedi.

Pandeminin ilk günlerinde, Güney Afrika’nın sağlık yetkilileri HIV’li insanların ölüm oranlarındaki artışa hazırdı: “Temelde Afrika’nın yok olacağına dair korku senaryoları oluşturuyorduk,” diyor epidemiyolog Salim Abdool Karim KRISP’nin bulunduğu AIDS enstitüsü. “Ama bunların hiçbiri olmadı. Bunun ana nedeni, H.I.V.’nin en çok gençler arasında görülmesi, koronavirüsün ise en çok yaşlıları etkilemesi.

Bir H. I. V. enfeksiyonu, bir kişiyi Covid’den ölme olasılığını yaklaşık 1, 7 kat daha fazla yapar – yüksek bir risk, ancak ölme olasılığı 30 kat daha fazla olan diyabetli kişilerin riskine kıyasla sönük bir risk. Dr. Abdool Karim, “Durumun bu olduğunu anladıktan sonra, Covid’in ortasında H. I. V. ile olan gerçek sorunlarımızın, ciddi şekilde bağışıklığı baskılanmış insanların yeni varyantlara yol açması ihtimali olduğunu anlamaya başladık.” dedi.

KRISP’deki araştırmacılar bunun en az iki kez olduğunu gösterdi. Geçen yıl, etkisiz bir tedavi rejiminde olan ve tolere edebileceği ilaçları bulması için yardım edilmeyen H. I. V.’li 36 yaşındaki bir kadına bir virüs örneğinin izini sürdüler. Koronavirüsü sisteminden temizlemesi 216 gün sürdü; o sırada vücudunda virüsler 32 farklı mutasyon kazandı.

Kasım ayında, Dr. de Oliveira ve ekibi düzinelerce mutasyona sahip bir koronavirüs örneğini ülkenin farklı bir bölgesine, başka bir hastanın da H. I. V. ilaç rejimine zayıf bir şekilde uyduğu Western Cape’e kadar takip etti. Koronavirüs vücudunda aylarca kaldı ve onlarca mutasyon üretti. Bu kadınlara etkili ilaçlar reçete edildiğinde ve bunları nasıl düzgün bir şekilde alacakları konusunda tavsiyelerde bulunulduğunda, virüsü çabucak temizlediler.

Dr. Abdool Karim, koronavirüsü vücudundan temizlemesi 216 gün süren kadın için “Onun gibi pek fazla insanımız yok” dedi. “Ama çok fazla insan almaz, sadece bir veya iki kişi alır. ” Ve tek bir varyant, Omicron’un sahip olduğu gibi dünyayı sallayabilir.

Bu varyantın kökeni hala bilinmemektedir. Sistemleri istemeden koronavirüse mutasyona uğrama şansı veren sadece H. I. V.’li kişiler değil: Organ nakli hastaları ve kanser tedavisi görenler gibi bağışıklığı baskılanmış herkeste olabilir.

KRISP ekibi, H.I.V.’li bir kişinin koronavirüs varyantları ürettiği ikinci vakayı belirlediğinde, dünyanın diğer bölgelerinden tıp literatüründe aynı fenomene ilişkin bir düzineden fazla rapor vardı.

Virüsler, bağışıklık sistemi sağlıklı kişilerde de mutasyona uğrar. H. I. V. veya başka bir bağışıklığı baskılayıcı durumu olan kişiler için fark, virüs sistemlerinde çok daha uzun süre kaldığı için, doğal seçilim sürecinin bağışıklıktan kaçan mutasyonları desteklemek için daha fazla zamana sahip olmasıdır. Sağlıklı bir insanda tipik replikasyon periyodu, birkaç ay yerine sadece birkaç hafta olacaktır; daha az çoğaltma, yeni mutasyonlar için daha az fırsat anlamına gelir.

Güney Afrika’da H.I.V.’li çok sayıda insan bulunduğundan ve bu yeni pandemi burada hayatı birçok yönden kesintiye uğrattığından, varyantları engellemeye çalışmak için özel bir aciliyet var.

Bu, Bayan Mathe gibi toplum sağlığı çalışanlarının çabalarının devreye girdiği yerdir. Tipik bir iş gününde, eski bir cep telefonu ve zihinsel bir liste ile donanmış olarak, sızdıran boruların ve ön basamak kuaför salonlarının yanından toprak yollarda yürür. Son zamanlarda kliniğe geldi, kim iyi görünmüyor ve kimin ziyarete ihtiyacı var. 13 yıldır H.I.V. tedavisi gören Bayan Mathe’ye ayda 150 dolar ödeniyor.

36 yaşında zayıf bir üç çocuk annesi olan Silendile Mdunge, Mayıs ve Temmuz ayları arasında Güney Afrika’yı vuran vahşi üçüncü Covid dalgası sırasında antiretrovirallerini almayı bıraktı. Pek çok sağlık çalışanı yeniden görevlendirildiği için ilaçları artık yakındaki bir topluluk toplama noktasına teslim edilmiyor. Bunun yerine hapları yaklaşık dokuz mil uzaktaki merkezi bir klinikte toplaması gerekiyordu. Ancak bu yeni virüsü ortak bir takside kapmaktan ya da duyduğu büyük klinik kuyruklarında durmaktan korkuyordu.

Bayan Mathe, Bayan Mdunge’nin yedi aile üyesiyle paylaştığı, hurda ahşaptan inşa edilmiş küçük eve gelmeden önce dört ay boyunca ilaçsızdı.

Mdunge, ılık, hafif bir yağmurda sert kapı çerçevesine yaslanarak, “Bana tedavisini yapamayan insanların artık yaşamadığını, çocuklarımı düşünmem gerektiğini, ölebileceğimi söyledi” dedi. . Bunlar soyut olarak zaten bildiği şeylerdi.

Ancak Mathe Hanım’ın ısrarlı varlığı, uyarıları görmezden gelmeyi zorlaştırdı. Bayan Mdunge omuz silkip gözlerini devirerek, her şey kadar rahatsız etmeye son vermek için tedaviye yeniden başlamasını önerdi.

Bayan Mathe, yöntemlerinin bu anlatımını bir sırıtışla dinledi. İnsanları sevmeseydin bu işi yapmazdın dedi.

H.I.V.’li sekiz milyon Güney Afrikalı’nın 5,2 milyonu tedavi görüyor – ancak bu grubun sadece üçte ikisi virüsü ilaçla başarıyla bastırıyor. Sorun Güney Afrika sınırlarının ötesine uzanıyor: Sahra altı Afrika’da 25 milyon insan virüsle yaşıyor ve bunların 17 milyonu tedavi ile viral olarak bastırılıyor.

KRISP laboratuvarı, kendi kapasitesine sahip olmayan ülkeler için bazı boşlukları doldurmak için Afrika’nın dört bir yanından koronavirüs örneklerini sıralıyor. Güney Afrika’nın gözetim ağı ve genomik dizilimi, araştırmacılarının ülkeden kaynaklanmayan vakaları bile ilk tespit edebilecek kadar kapsamlıdır.

Büyük korku, “bağışıklık kaçışı” olan bir varyanttır: Covid aşılarından kaçma yeteneği veya önceki enfeksiyonun ortaya çıkardığı bağışıklık tepkisi. Güney Afrika’da giderek daha fazla insan Covid’e karşı aşılandıkça, aşılanmış bir kişinin vücudunda bir varyantın demlenme potansiyeli var.

Güney Afrika’nın Covid müdahalesine öncülük eden Dr. Abdool Karim, “Gerçekten kötü varyantlar yaratma potansiyeline sahip olduğunuz bir durumunuz var” dedi. Önceki varyantlar, az sayıda insanın aşıya erişimi olduğu zaman ortaya çıktı, ancak şimdi Güney Afrika aşıyı vatandaşlarının üçte birinden fazlasına teslim etti. H. I. V. ile aşılanmış kişiler antiretroviralleri yoksa veya almıyorlarsa, virüsün aşıdan kaçmak için mutasyona uğraması için bir fırsat olabilir.

“Şimdi, bu H.I.V. hastalarının çoğu aşılandı, bu yüzden bağışıklık tepkileri var. Dolayısıyla, yeni bir varyant oluşturacaklarsa, bu varyantın bu bağışıklık tepkilerinden kaçması gerekecek,” dedi Dr. Abdool Karim.

Dr. de Oliveira, Güney Afrika’da ortaya çıkan aşıya dirençli bir varyanttan daha az endişe duyduğunu, örneğin Amerika Birleşik Devletleri’nde tedavi edilmemiş H.I.V., düşük aşı kapsamı ve Güney Afrika’dan daha zayıf bir gözetim ağı ile endişelendiğini söyledi.

“Önce onu bulma ihtimalimiz var,” dedi sert bir kahkahayla.

Kontrolsüz H. I. V.’li kişilerde virüsün mutasyona uğrama riskinden farkı, bunun hazır bir çözümle ilgili bir sorun olduğuna işaret etti – herkesin H. I. V.’yi tedavi altına alması – bir nakil veya kanser hastasının hiçbir seçeneği yok.

Her şeyden önce, varyant tehdidini sona erdirmenin cevabı, koronavirüs bulaşmasını engellemektir. Afrika’nın nüfusunu aşılayın, aşılayın, aşılayın” dedi. “Endişem aşı milliyetçiliği veya aşının istiflenmesi. Bağışıklık tepkilerinin etkinliğini en üst düzeye çıkarmak için H.I.V.’li kişilere aşı güçlendiriciler için öncelik verilmesi gerektiğini de sözlerine ekledi.

Şimdiye kadar, Güney Afrika’nın varyant sorununu çözme ve bu konuda şeffaf olma çabaları, uçuş yasakları ve küresel izolasyon şeklinde yüksek bir bedelle geldi.

Dr. de Oliveira geçen hafta laboratuvarında “Bilim adamları olarak, özellikle ön planda olan türlerde, H. I. V. problemini hafife almayı tartışıyoruz,” dedi. “Eğer sesimizi çok yükseltirsek, yine büyük bir ayrımcılık, sınırların kapatılması ve ekonomik önlemler riskini de alırız. Ama çok sesiniz çıkmıyorsa gereksiz ölümlerimiz oluyor. ”

Carl Zimmer raporlamaya katkıda bulundu.