Avrupa projeleri COVID-19’u yenmek için veri topluyor
Futuris, bilimsel topluluğun COVID-19’u yenmesine yardımcı olmak için veri toplayan ve paylaşan iki Avrupa projesine bakmak için Marsilya ve Cambridge’e gidiyor.
Futuris, bilimsel topluluğun COVID-19’u yenmesine yardımcı olmak için veri toplayan ve paylaşan iki Avrupa projesine bakmak için Marsilya ve Cambridge’e gidiyor.
Bilim dünyasının bir kısmı SARS-Cov2 virüsüyle mücadele ederken, Marsilya’daki Avrupa Virüs Arşivi gibi enstitüler, bu tür patojenlerin hala var olduğundan emin oluyor.
Başlangıcından bu yana on iki yıl geçen EVA, dünyanın en önemli veritabanlarından biri haline geldi. Virüsler, test maddeleri ve diğer malzeme türleri dahil olmak üzere 3000’den fazla ürüne sahiptir.
EVA’nın proje koordinatörü Jean Louis Romette, “Bu koleksiyon sanal bir koleksiyon. Fikir, tüm virüsleri bir viroloji Kalesi Knox’u gibi aynı yere koymak değildi. Virüsler her laboratuvarda kalıyor” diyor.
Bu kar amacı gütmeyen AB projesi, bilim insanlarına virüsle ilgili bir acil durum sırasında ihtiyaç duydukları bilgi ve materyali hızla sağlamayı mümkün kılıyor.
Romette, “Koronavirüs Çin’de ortaya çıktığında EVA organizasyonundaki koronavirüs araştırmacılarımız bu virüsün SARS ailesinden biri olduğunu hemen gördüler ve hasta numunelerinde virüsü tespit etmek için hızla bir teşhis sistemi geliştirdiler” diye ekliyor.
Marsilya merkezli Enstitü insan, hayvan ve bitki virolojik araştırmalarında yaklaşık kırk son teknoloji laboratuvarı bir araya getiriyor. Çevrimiçi kataloğu, kullanıcıların genetik materyale ve diğer çeşitli ürünlere erişmesine olanak tanır. Koronavirüs pandemisi, çevrimiçi trafiğin artmasına neden oldu: sadece iki ay içinde teşhis kitleri ve viral suşlar için talepler, önceki dört yılda alınan taleplerle eşleşti.
“Yeni ortaya çıkan bir virüsünüz olduğunda ve bununla ilgili çok az veri olduğunda, onu aynı aileden mevcut diğer virüslerle karşılaştırabilmek çok önemlidir. Dolayısıyla biyo-bankalar, izin verdikleri için bu anlamda yararlıdır. yeni olanı zaten var olanla karşı karşıya getirmemiz gerekiyor” diye açıklıyor EVA’nın Pazar Stratejisi Geliştiricisi Christine Prat.
Virolojik materyal araştırma merkezleri, laboratuvarlar, üniversiteler ve uzman şirketler tarafından gönderilir. Ulaştığında test edilir, onaylanır ve bilimsel topluluk için çok önemli olan derinlemesine bilgilerle birlikte çevrimiçi bir katalogda dosyalanır.
Bruno Coutard, EVA’nın aldıklarını harmanlamaktan sorumludur.
“Hücre kültürü teknikleriyle bilgi miktarını artırıyoruz. Hücre kültürlerini kullanarak virüsü büyütebiliyor, üretebiliyor ve ayırt edebiliyoruz. Ayırt etmeye dizileme dediğimiz şey, virüsün tam genom dizisini elde etmek. Bu virüsü bilinen bir virüs türüyle ilişkilendirmemiz gerekiyor” diyor.
“Bir salgın sırasında çalışmak için fazla zamanınız olmaz.”
EVA’nın Gelişen Virüs Birimi Direktörü Xavier Lamballerie, bir salgın patlak verdiğinde bilim adamlarının güncellenmiş modellere ve çalışmalara hızla güvenebilmelerinin önemli olduğunu söylüyor.
“Bir salgın sırasında çalışmak için fazla zamanınız olmaz. Salgınlar genellikle kısa sürer. İnsanlar farklı ve yetersiz tanımlanmış malzemelerle çalışırsa, bunları karşılaştırmak için asla tüm çalışmaları bir araya getiremeyiz. Referans koleksiyonunun rolü EVA gibi, mümkün olduğu kadar çok ortağa çok hızlı bir şekilde aynı ürünleri, çok iyi tanımlanmış şekilde sağlamak, böylece onlarla araştırma yapabilirler.”
Fransız enstitüsü, güvenilir ve kullanımı basit test kiti göndererek gelişmekte olan ülkelere de yardım sağlayabilmiştir.
“EVA veri tabanı, dondurularak kurutulmuş tanı araçları geliştirmemize ve hazırlamamıza olanak tanıyor, bu nedenle oda sıcaklığında kararlılar. Buzdolabına kaldırılmadan gönderilebilirler. Kullanılabilirler, zaman içinde son derece kararlıdırlar ve laboratuvarlar Virüs Toplama Sorumlusu Remi Charrel, bunları sahadakilere benzer koşullar altında kullanın” diyor.
Salgınla savaşan biyoloji portalı
Avrupa Moleküler Biyoloji Laboratuvarı veya EMBL, moleküler biyoloji çalışmaları için dünyanın en önemli merkezlerinden biridir. Avrupa Biyoinformatik Enstitüsü’ne ev sahipliği yapan Nisan ayında, SARS-CoV-2 ile ilgili en son verileri paylaşmak için Avrupa COVID-19 Veri Platformu adlı bir proje başlatıldı.
Araştırma merkezlerinden ve hastanelerden toplanan bilgiler, bir kez analiz edildikten sonra uluslararası bilim camiasının geri kalanına sunulur.
“170’den fazla ülkeden 50.000’den fazla kişi erişti. Bu, küresel olarak erişilebilir olduğunu ve fiilen kullanıldığını gösteriyor. Portal aracılığıyla 2 milyonun üzerinde web talebi ve indirme ve araştırma için 90.000’in üzerinde bilimsel makale aldık. ” diye açıklıyor Kıdemli Bilimsel Hizmetler Görevlisi Amonida Zadissa.
Genom dizileri, proteinler ve mikroskop gözlemleri gibi verilerin tümü bir portala yüklenir. Platform aynı zamanda araştırmacıların farklı bilgi kaynaklarını incelemesine olanak sağlayan analitik araçları da içerir.
Guy Cochrane, Veri Koordinasyonu ve Arşivleme Ekip Lideri: “Bilimsel çalışmalardan, halk sağlığından, laboratuvarlardan, kliniklerden üretilen yeni verilere ve tüm bunları kullanıcının tükettiği değerli bir bütün halinde bir araya getirmeye odaklanıyoruz. veri ve bilimi zirvede inşa etmek, hepsi tek bir yerde olan veriler içinde erişimde gezinebilir ve hareket edebilir.”
Bir veri merkezleri ağı
COVID-19 Veri Portalı, daha geniş bir SARS-CoV-2 veri merkezleri ağı oluşturmanın ilk adımı olarak görülüyor. Sonunda bunlardan elde edilen bilgiler, küresel araştırma topluluğu için kapsamlı bir resim sağlamalıdır. Avrupa Moleküler Biyoloji Laboratuvarı Direktörü Rolf Apweiler, veri ve bilgi paylaşımını geliştirmenin kilit nokta olduğunu söylüyor.
“Hedefimiz, önce halihazırda merkezi bir veri tabanında depolanmış olan tüm verileri toplayıp portalda bir araya getirmek ve ardından şu anda toplanan genetik verilerle ve son olarak klinik verilerle bağlantı kurmaktır. Orada. Yani kullanım oldukça hızlı artıyor. Alım harika, çok fazla geri bildirimimiz var, gelecekte birçok işbirliğimiz var. Yani, bilim elinden gelenin en iyisini yapıyor.”
Cambridge’deki bilim adamları, COVID-19’a karşı mücadelenin küresel olduğu konusunda netler, ancak bu şekilde veri paylaşmanın aşıya giden yolu kısaltacağından eminler.
Avrupa COVID-19 Veri Platformu, Avrupa Komisyonu ve ulusal makamların 10 kısa vadeli araştırma ve yenilik eylemiyle koronavirüsle mücadele etme girişimi olan ERAvsCorona Eylem Planının eylemlerinden biridir. Eylem planı, Avrupa Araştırma Alanının (ERA) genel hedefleri ve araçları üzerine kuruludur.
Euronews’in bir haberine göre haberleştirildi.
