Bilim Adamları, ABD’nin Bulaşıcı Yeni Virüs Varyantına Kör Olduğunu Uyardı

Koronavirüsün genetik varyasyonlarını tanımlayacak sağlam bir sistem bulunmayan uzmanlar, Amerika Birleşik Devletleri’nin tehlikeli yeni bir mutantı takip etmek için ne yazık ki yetersiz olduğu konusunda uyarıyor ve sağlık görevlilerini ciddi tehditle mücadele etmeye çalışırken kör bırakıyor.

Şu anda İngiltere’de yükselen ve hastanelerini yeni vakalarla dolduran varyant, şimdilik Amerika Birleşik Devletleri’nde nadirdir. Ancak önümüzdeki birkaç hafta içinde patlama potansiyeli var ve Amerikan hastaneleri üzerinde, bazıları zaten kırılma noktasına yakın olan yeni baskılar oluşturuyor.

Amerika Birleşik Devletleri, yeni varyant tarafından taşınanlar da dahil olmak üzere, yeni mutasyonlar için koronavirüs genomlarını kontrol etmek için ülke çapında büyük ölçekli bir sisteme sahip değil. Her hafta yaklaşık 1.4 milyon kişi virüs için pozitif test yapıyor, ancak araştırmacılar, bu haftalık numunelerin 3.000’den daha azında yalnızca genom dizilimi yapıyor – yeni varyantı kesin olarak tespit edebilen bir yöntem. Ve bu çalışma akademik, eyalet ve ticari laboratuvarlardan oluşan bir yama çalışması tarafından yapılıyor.

Bilim adamları, ulusal bir sürveyans programının, yeni varyantın ne kadar yaygın olduğunu belirleyebileceğini ve ortaya çıkan sıcak noktaları kontrol altına almaya yardımcı olarak, ülke çapındaki savunmasız kişilerin aşılanabileceği kritik zaman aralığını uzatacağını söylüyorlar. Bu birkaç yüz milyon dolara veya daha fazlasına mal olur. Bu çok yüksek bir fiyat etiketi gibi görünse de, Birleşik Devletler’in Covid-19 nedeniyle uğradığı tahmin edilen ekonomik kayıpların 16 trilyon dolarının çok küçük bir kısmı.

Ekibi, yeni varyantın ilk California vakalarından bazılarını tespit eden San Francisco’daki California Üniversitesi’nde araştırmacı olan Dr. Charles Chiu, “Bir tür liderliğe ihtiyacımız var” dedi. “Bu, ulusal düzeyde uygulanan bir sistem olmalı. Bu tür bir özel destek olmadan, bu kesinlikle yapılamaz. ”

Böyle bir sistem yürürlükte olduğunda, sağlık görevlileri etkilenen bölgelerdeki halkı uyarabilir ve daha iyi maskeler kullanmak, temas takibi yapmak, okulları kapatmak veya geçici kilitlenmeler gibi varyantla mücadele etmek için yeni önlemler alabilir ve bunu beklemek yerine erken yapabilir. yeni bir dalgalanma hastaneleri hasta ile doldurdu.

Yeni gelen Biden yönetimi bu fikre açık olabilir. Geçiş sözcüsü T. J. Ducklo, “Başkan-Seçilmiş, COVID-19’un yayılmasını durdurmaya ve varyantları bulmaya yardımcı olabilecek ulusal bir test programını destekliyor” dedi. Bu, daha fazla test, daha yüksek laboratuvar kapasitesi ve genom dizilimi anlamına geliyor. Bu, COVID-19’u kontrol etmek ve Amerika Birleşik Devletleri’ni gelecekteki hastalık tehditlerini tespit edip durdurmaya hazırlamak için çok önemlidir. ”

Uzmanlar, İngiltere’nin ABD’nin yapabilecekleri için bir model olduğunu gösteriyor. İngiliz araştırmacılar, yeni pozitif örneklerin yüzde 10’una varan oranlarda genomu – yani bir koronavirüsteki tüm genetik materyali – sıralıyor. ABD, ülkenin dört bir yanından genomların yalnızca yüzde birini veya günde yaklaşık 2.000 yeni örneği sıralasa bile, bu yeni varyantın yanı sıra ortaya çıkabilecek diğer varyantlara da parlak bir ışık tutacaktır.

Geçen ay İngiltere’nin güneydoğusundaki Dover limanında bir test sahası. İngiltere, Mart ayından bu yana, dünyadaki tüm dizili koronavirüs genomlarının neredeyse yarısı olan 146.463 koronavirüs genomunu sıraladı. Kredi. . . Justin Tallis / Agence France-Presse – Getty Images

Ancak ABD şu anda bu hedefin çok gerisinde kalıyor. Araştırmacıların koronavirüslerden yeni genomları paylaştığı uluslararası bir veritabanı olan GISAID’e göre, geçen ay Amerikalı araştırmacılar günde yalnızca birkaç yüz genomu sıraladı. Ve çabaların çoğundan sadece birkaç eyalet sorumlu oldu. California, 8,896 genom ile lider konumdadır. Şimdiye kadar 93.500’den fazla vakaya sahip olan Kuzey Dakota’da, araştırmacılar tek bir genom dizilemedi.

İngiltere, Mart ayında birçok Amerikalı uzmanın özlemini duyduğu şeyi başlattı: Yeni koronavirüsün mutasyonlarını izlemek için iyi yönetilen bir ulusal program. Ülke, ülke çapındaki hastaneleri görevlendiren bilimsel bir konsorsiyum oluşturmak için 20 milyon sterlin (yaklaşık 27 milyon dolar) yatırım yaptı ve virüslerini sıralayacak özel laboratuvarlara numune göndermek için standart prosedürler verdi. Bulut bilişimi kullanarak, uzmanlar mutasyonları analiz ettiler ve virüsün her soyunun evrimsel bir ağaca nerede oturduğunu buldular.

Patojenleri takip etmek için Seattle merkezli bir proje olan Nextstrain’in oluşturulmasına yardımcı olan İsviçre’deki Bern Üniversitesi’nden moleküler epidemiyolog Emma Hodcroft, “Birleşik Krallık’ın sıralama ile yaptığı şey, bana göre pandeminin ay görüntüsüydü,” dedi. “Sıralama yapmaya karar verdiler ve tamamen inanılmaz bir programı sıfırdan başlattılar. ”

İngiltere’nin koronavirüsün genetik evrimini takip etmeye yönelik yoğun programı, muhtemelen geçen ay B1 olarak bilinen yeni varyantı tanımlayan ilk ülke olmasının nedenidir. 1. 7. İngiltere şu ana kadar 209.038 koronavirüs genomunu sıraladı – neredeyse üçte ikisi Dünyada dizilenenlerin hepsi. Beş kat daha büyük bir ülke olan ABD, yalnızca 58.560 genom diziledi.

ABD’de, çoğunlukla üniversitelerde bulunan bir takım laboratuarlar ilkbahardan beri koronavirüs genomlarını analiz ediyor. Birçoğu işi yapmak için kendi mütevazı fonlarını harcıyor. San Diego’daki Scripps Araştırma Enstitüsü’nde bu çabaların ön saflarında yer alan bir virolog olan Kristian Andersen, “Her şey onu yerden kaldırmak için bu çim kökleri hareketlerine bağlı,” dedi.

Dr.Andersen ve diğer bilim adamları, dünya ve Amerika Birleşik Devletleri’ne yayılırken koronavirüsün yolunu aydınlattı. Amerika Birleşik Devletleri’ndeki ilk vakalardan bazıları, yeni koronavirüsün doğum yeri olan Çin’de ortaya çıktı, ancak çoğu vakayı birçok Amerikan şehrine getiren Avrupalı ​​gezginlerdi.

Ancak bu ilk başarıların ardından, tarama sadece küçük bir ölçekte devam etti. Dr. Andersen, “Genomik gözetlemede kesinlikle bir devrime yol açmadı,” dedi.

Mayıs ayında Hastalık Kontrol ve Önleme Merkezleri, Birleşik Devletler’deki düzinelerce laboratuvarı bir konsorsiyumda bir araya getirdi. Halk Sağlığı Acil Müdahale, Epidemiyoloji ve Gözetim konsorsiyumu veya SPHERES için SARS-CoV-2 Sıralaması olarak bilinir.

SPHERES’e katılan bilim adamları bunun iyi bir başlangıç ​​olduğunu söylüyorlar. Dr. Hodcroft, “Amerika Birleşik Devletleri’ndeki bilim adamları, akademisyenler ve araştırmacıların birbirlerine yardım etmeleri için gerçekten yararlı bir ağ sağladı,” dedi. Koronavirüs genomlarını dizileme çabasına katılmak isteyen laboratuvarlar, bilimsel çarkı yeniden icat etmek yerine diğer laboratuvarlardan tavsiye alabilir.

Ancak, mutasyonların ABD genelinde dikkatle izlenmesini sağlamak için açık bir yetkiye ve kaynaklara sahip ulusal bir program değil Dr. Andersen, “Ülke olarak genomik sürveyansa ihtiyacımız var” dedi. Federal bir yetkiye ihtiyacı var. ”

C. D. C., SPHERES’i çalıştıran bilim adamlarını röportaj için uygun kılmayı reddetti. “C. Ajansın sözcülerinden Brian Katzowitz yaptığı açıklamada, D. C., her hafta binlerce örneği sıralamak için ülke içi gerginlik sürveyans kapasitesini artırmak için eyalet halk sağlığı, akademik ve ticari laboratuvarlarla birlikte çalışıyor ”dedi.

Çarşamba günü, gen dizileme şirketleri Helix ve Illumina, C.D.C.’nin desteğiyle B. 1. 1. 7’nin ortaya çıkışını izlemek için bir işbirliğini duyurdular. Şirketler, haftada 1.000’e kadar genom diziliyor. Ancak Illumina sözcüsü Karen Birmingham, pilot programın ulusal bir çabadan çok uzak olduğunu hızlıca ifade etti. “ABD genelinde genomik sürveyansı çok daha geniş ve koordineli bir şekilde karşılıyoruz” dedi.

Britanya’nın güçlü genetik izleme sistemi, bilim adamlarının yeni varyantın ne kadar tehlikeli olduğunu daha iyi anlamalarına olanak sağladı. İngiltere’nin sıralama konsorsiyumundaki araştırmacılar tarafından Pazartesi günü yayınlanan üzücü bir çalışma, ülkenin Kasım ayı kilitlenmesinin koronavirüsün sıradan varyantlarının yayılmasını yavaşlatmak için iyi bir iş çıkardığını, ancak B. 1. 1. 7’nin yayılmasını durdurmadığını ortaya koydu.

Epidemiyologlar, bir virüsün yayılma oranını üreme sayısı adı verilen bir şeyle ölçer. Üreme sayısı 1 ise, bu, enfekte olan her kişinin ortalama olarak bunu bir başka kişiye aktarması anlamına gelir. Büyüyen bir salgının üreme sayısı 1’den büyükken, azalan salgının 1’den az olduğu tahmin ediliyor. İngiliz araştırmacılar, B. 1. 1. 7 dışındaki koronavirüslerin kilitlenme sırasında üreme sayısı 0, 95 iken, B. 1. 1. 7’nin üreme sayısı 1.45’tir.

B. 1. 1. 7’nin daha yaygın hale gelme hızı, bir konakçıdan diğerine daha iyi yayılmasını sağlayan bazı biyolojik özelliklere sahip olduğunu göstermektedir. Laboratuvar deneyleri, bazı mutasyonlarının virüsün hava yolundaki hücrelere daha başarılı bir şekilde bağlanmasını sağlayabileceğini göstermiştir.

Pazartesi günü İngiliz hükümeti, ülkenin Kasım ayına göre daha da sıkı bir ulusal kilitlemeye girdiğini açıkladı. Hükümet bir tavsiyede, “Gerekmedikçe evinizden ayrılmamalı veya evinizin dışında bulunmamalısınız” dedi.

B. 1. 1. 7’nin Amerikan salgınını nasıl etkileyeceğini bilmek için henüz çok erken – ve en önemlisi, Birleşik Devletler’deki hastanelerde olduğu gibi ABD hastanelerini de etkisiz hale getirip getirmeyeceğini. Enfekte olan çoğu insan virüsü başkalarına geçirmez. İnsanların küçük bir kısmı, süper yayılan olaylarda yayılmasının çoğundan sorumludur. Aynı anda birçok insanı enfekte etmek için doğru zamanda doğru yere gelirler.

Ancak yeni varyant İngiltere’deki ile aynı yörüngeyi takip ederse, önümüzdeki haftalarda daha yaygın, daha az bulaşıcı varyantları geride bırakmaya başlayacaktır. Yale Üniversitesi’nden virolog Nathan Grubaugh, “Önümüzdeki birkaç ay içinde baskın virüs haline gelebilir” dedi.

Yine de kesin olan bir şey var. Halk sağlığı çalışanları, görmedikçe varyantı durduramayacaktır. Grubaugh ve diğer bilim adamları B. 1. 1. 7., koronavirüsün herhangi bir varyantını test etmek için kullanılabilecek hızlı ve ucuz bir teknoloji olan P.C.R’yi kullanan özel testler oluşturuyorlar.

Ancak Dr. Grubaugh, Amerika Birleşik Devletleri’ne tehlikeli yeni bir varyant geldikten çok sonra araştırmacıların bu testleri oluşturmak için uğraşmak zorunda kalmamalarının çok daha iyi olacağını söyledi. “Genel olarak, genomik gözetim eksikliğimiz üzerine bir Yara Yardımı” dedi.

Koronavirüsün evrimini izlemek için ülke çapında bir sürveyans programı, araştırmacıların yalnızca B. 1. 1. 7.’nin yayılmasını gözlemlemelerine izin vermekle kalmaz, aynı zamanda soyunda ortaya çıkan potansiyel olarak daha tehlikeli yeni mutasyonları da gözlemlemelerine izin verir. Yeni varyantlar, insan hücrelerini enfekte etmede daha etkili olabilir veya daha kötüsü, aşılardan veya antiviral ilaçlardan kaçınabilir.

Dr. Hodcroft, “Bunu biz kurmamış olmamız, yapamayacağımız anlamına gelmez,” dedi. “Bunun istediğimiz bir şey olduğuna gerçekten karar vermeliyiz. ”

Bu tehlikeli yeni böcekleri bulmanın tek yolunun onları sürekli izlemek olacağını vurguladı. “İlk gün ortaya çıkıyorlar ve kendilerini tanıtıyorlar ve ‘Hey, beni izle!’ Diyorlar” dedi. Bunu anlamamız biraz zaman alıyor. Ve bakmazsak daha uzun sürer. “